اولین جلسه شورایعالی علوم، تحقیقات و فناوری در تاریخ 13/12/1383 به ریاست آقای حجت الاسلام خاتمی، رئیس جمهور وقت و رئیس شورای عالی علوم، تحقیقات و فناوری برگزار شد.
دستور اولین جلسه شورای عالی علوم، تحقیقات و فناوری به شرح زیر بود:
- سخنان وزیر علوم، تحقیقات و فناوری
- گزارش وضعیت علوم، تحقیقات و فناوری در کشور
- اظهار نظر اعضای شورای عالی
- رهنمودهای رئیس جمهور
- بررسی شرح تفصیلی وظایف شورای عالی
- تصویب آییننامه داخلی شورای عالی
- بررسی نحوه تامین منابع مالی مورد نیاز دبیرخانه
در این جلسه شرح تفصیلی وظایف شورای عالی علوم، تحقیقات و فناوری و آییننامه داخلی شورایعالیعلوم، تحقیقات و فناوری تصویب شدند و لیکن مصوبات ابلاغ نشد.